title ru

Архив журнала > 2012 > № 4, июль-август

СТЕХИОМЕТРИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ ФОЛАТЗАВИСИМОГО
МЕТАБОЛИЗМА ОДНОУГЛЕРОДНЫХ ФРАГМЕНТОВ
В ПЛАЦЕНТЕ ЧЕЛОВЕКА

Р. Р. Родригес1, И. С. Лущик2, М. Ю. Оболенская1

1Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины, Киев;
e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.;
2Национальный университет «Киево-Могилянская Академия», Украина

Работа посвящена созданию математической модели фолатзависимого метаболизма одноуглеродных групп (ФЗМОГ) и исследованию ее функционирования в плаценте человека в условиях нагрузки гомоцистеином и распространенных мутаций в генах метилентетрагидрофолатредуктазы (МТГФР) и цистатионин-?-синтазы (ЦБС). При моделировании учтены специфические для плаценты особенности экспрессии генов, кодирующих энзимы ФЗМОГ. С помощью программных инструментов Metatool и COBRAToolbox определены ключевые метаболиты, элементарные моды и метаболические потоки в различных реакциях системы. Показано, что наиболее уязвимыми звеньями системы являются реакции фолатного цикла и синтеза предшественников нуклеиновых кислот, инозин- и тимидинмонофосфатов, которые в зависимости от наложенных условий изменяются в пределах от существенного подавления до активации. Наиболее стабильными звеньями системы являются реакции синтеза глутатиона и таурина. Результаты моделирования ФЗМОГ совпадают с результатами, экспериментально полученными при сходных условиях. В некоторых наложенных условиях проявляются ранее неочевидные связи между звеньями системы, что является основанием для целенаправленной проверки предсказаний, полученных с помощью модели.

Ключевые слова: фолатзависимый метаболизм одноуглеродных фрагментов, стехиометрическая модель, гомоцистеин, полиморфизм, метилентетрагидрофолатредуктаза, цистатионин-?-синтаза.

Оригинал статьи на украинском языке доступен для скачивания в формате PDF.

© Украинский биохимический журнал