title ru

Архив журнала > 2008 > № 4, июль-август

СОВРЕМЕННЫЕ МЕТОДИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ
К ОПРЕДЕЛЕНИЮ СТАТУСА МЕТИЛИРОВАНИЯ ДНК
И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ В ОНКОЛОГИИ

С. М. Кваша

Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины, Киев;
e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Эпигеномные модификации генома человека играют важную роль в регуляции экспрессии генов и формировании структуры хроматина. Метилирование цитозина CpG-динуклеотидов – одна из основных эпигеномных модификаций генома человека. Изменение статуса метилирования CpG-островков генов-супрессоров опухолей и онкогенов играет важную роль в канцерогенезе. Достоверное определение статуса метилирования ДНК является важным для ранней диагностики опухолей, выбора и мониторинга лечения, прогноза после­операционного выживания пациентов с опухолями. В настоящее время существует широкий круг подходов к определению статуса метилирования ДНК. Цель этого обзора – охарактеризовать основные подходы к определению статуса метилирования CpG-динуклеотидов, которые возможно применять в онкологии. К этим подходам относятся: бисульфитное секвенирование, бисульфитное пиросеквенирование, MS-REA (methylation-sensitive restriction endonuclease assay), MSP (methylation-specific PCR), COBRA (combined bisulfite restriction analysis), MS SnuPE (methylation-sensitive single nucleotide primer extension), MS-SSCA (methylation-sensitive single-strand conformation analysis), MethyLight, HeavyMethyl, MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption/ionization time-to-flight mass spectrometry), FMCA (fluorescence melting curve analysis), рестрикционное сканирование генома, применение микрочипов для определения генов с повышенной экспрессией после ингибирования метилирования ДНК, DMH (differential methylation hybridization), использование способности метил-CpG-связывающего домена белка MeCP2 связывать метилированную ДНК, иммунопреципитация метилированной ДНК с помощью специфических антител к метилированным цитизинам. Для каждого метода описано общий принцип, преимущества, недостатки и потенциальные артефакты.

Ключевые слова: CpG-динуклеотид, метилирование ДНК, опухоль.

Оригинал статьи на украинском языке доступен для скачивания в формате PDF.

© Украинский биохимический журнал