title ua

Архів журналу > 2014 >№ 2, березень-квітень

ІДЕНТИФІКАЦІЯ МАЛИХ РНК У ПОЛІЕДРАХ ВІРУСА
ЯДЕРНОГО ПОЛІЕДРОЗУ Bombyx mori

Т. В. Ширина, Г. В. Геращенко, М. Т. Бобровська, В. І. Кашуба

Інститут молекулярної біології та генетики НАН України, Київ;
e-mail: Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. Вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її.

Біоінформативними методами показано, що ділянки геному вірусу ядерного поліедрозу Bombyx mori кодують дві малі РНК – snc RNA 1 та snc RNA-2, які можуть виконувати структурну функцію під час формування кристалів поліедрів. Метою роботи є встановлення нуклеотидної послідовності малих некодуючих РНК, які були передбачені біоінформативними методами, з поліедрів B. mori. У роботі використано полімеразну ланцюгову реакцію (ПЛР), електрофорез в агарозному гелі, клонування продуктів ПЛР, секвенування. Встановлено, що нуклеотидні послі­довності snc RNA-1 та snc RNA-2, які комплементарні ділянкам мРНК поліедрів, включаються в поліедри B. mori. Ці РНК 100% но ідентичні послідовностям, передбаченим нами біоінформативними методами. Одержані резуль­тати підтверджують запропонований нами біоінформативний підхід до пошуку малих РНК, які закодовані у геномі B. mori.

Ключові слова: вірус ядерного поліедрозу, Bombyx mori, поліедри, малі некодуючі РНК, секвенування.

Оригiнал статтi росiйською мовою доступний для зкачування в форматi PDF.

© Український бiохiмiчний журнал