Архів журналу > 2011 > № 5, вересень-жовтень

СТРУКТУРНА ГНУЧКІСТЬ ДНК-ПОДІБНИХ КОНФОРМЕРІВ
КАНОНІЧНИХ 2?-ДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДІВ

Т. Ю. Ніколаєнко1, Л. А. Булавін1, Д. М. Говорун1,2

1Київський національний університет імені Тараса Шевченка, Україна;
2Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, Київ;
е-mail: Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. Вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її.

За допомогою оригінальних методик вивчено характеристики структурної гнучкості елементарних мономерних ланок ланцюгів ДНК: молекул 5?-дезоксицитидилової, 5?-тимідилової, 5?-дезоксіаденілової та 5?-дезоксигуанілової кислот в їхніх ДНК-подібних конформаціях. Знайдено величини середньоквадратичних відхилень (4°?25° при 0 К і 7°?50° при 298 К) усіх їхніх конформаційних параметрів від рівноважних значень, обумовлених тепловими або квантовими нульовими коливаннями ядер, а також значення релаксованих силових сталих (1?35 ккал/моль·рад-2). Виявлено конформаційну чутливість цих величин. Доведено, що кут ? є найжорсткішим, а релаксовані силові сталі для решти конформаційних змінних менші і сумірні між собою. Одержані дані можуть бути використані для побудови структурно-динамічних моделей ДНК.

Ключові слова: структурна гнучкість, релаксовані силові сталі, коливальні відхилення конформаційних параметрів, 2?-дезоксирибонуклеотид, ДНК.

Оригiнал статтi українською мовою доступний для зкачування в форматi PDF.

© Український бiохiмiчний журнал