title ua

Архів журналу > 2008 > № 4, липень-серпень
 
СУЧАСНІ МЕТОДИЧНІ ПІДХОДИ ДО ВИЗНАЧЕННЯ СТАТУСУ
МЕТИЛЮВАННЯ ДНК ТА ЗАСТОСУВАННЯ ЇХ В ОНКОЛОГІЇ

 

 

С. М. Кваша

Інститут молекулярної біології та генетики НАН України, Київ;
e-mail: Ця електронна адреса захищена від спам-ботів. Вам потрібно увімкнути JavaScript, щоб побачити її.

Епігеномні модифікації геному людини відіграють важливу роль у регуляції експресії генів та формуванні структури хроматину. Метилювання цитозину CpG-динуклеотидів є однією з основних епігеномних модифікацій геному людини. Зміна статусу метилювання CpG-острівців пухлиносупресую­чих генів та онкогенів відіграє важливу роль у канцерогенезі. Вірогідне визначення статусу метилювання ДНК є важливим для ранньої діагностики пухлин, вибору і моніторингу лікування та прогнозу післяопераційної виживаності хворих із пухлинами. На сьогодні існує широке коло підходів до визначення статусу метилювання ДНК. Мета цього огляду охарактеризувати основні підходи до визначення статусу метилювання CpG-динуклеотидів, які можливо застосовувати в онкології. До цих підходів належать: бісульфітне секвенування, бісульфітне піросеквенування, MS-REA (methylation-sensitive restriction endonuclease assay), MSP (methylation-specific PCR), COBRA (combined bisulfite restriction analysis), MS-SnuPE (methylation-sensitive single nucleotide primer extension), MS-SSCA (methylation-sensitive single-strand conformation analysis), MethyLight, HeavyMethyl, MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption/ionization time-to-flight mass spectrometry), FMCA (fluorescence melting curve analysis), рестрикційне сканування геному, використання мікрочипів для визначення генів із підвищеною експресією після інгібування метилювання ДНК, DMH (differential methylation hybridization), використання здатності метил-CpG-зв’язувального домену білка MeCP2 зв’язувати метильовану ДНК, імунопреципітація метильованої ДНК за допомогою специфічних антитіл до метильованих цитозинів. Для кожного методу описано загальний принцип, переваги, недоліки та потенційні артефакти.

Ключові слова: CpG-динуклеотид, метилювання ДНК, пухлина.

Оригiнал статтi українською мовою доступний для зкачування в форматi PDF.

© Український бiохiмiчний журнал